Hola, segun tengo entendido no existen muchas cosas de las que vos nombras y por lo tanto no existen herramientas para eso.
Fragmentacion: Los sistemas de archivos EXT3 no fragmentan. En realidad es mentira que no fragmenta, el truco esta en que esa fragmentacion es tan tan chica, que bajo ningun punto de vista afecta al rendimiento. Pensa que esta tabulado el valor en un 0,001%. (que alguien me corrija si esta mal ese valor)
resumen: No existe defragmentador por que no fragmenta.
spyware/virus/adware/malware: no existen, asi ke nada. (existen antivirus para windows que corren en windows, pero eso es otra cosa)
registro tampoco existe, por suerte. cada configuracion de los programas se guarda en un archivo de texto y no depende de una base de datos en memoria....
limpieza de disco tampoco hace falta, por que linux utiliza una particion aparte para swapear, por lo tanto podes estar con 1 mb libre y el sistema te anda igual. (en realidad no es tan asi, por el tema de los logs, pero bueno)
lo mas parecido a scandisk es fsck. peeeeero ubuntu automaticamente te lo pasa cada 30 montadas de una particion, o cuando se te corto la luz y no pudiste apagar la pc, por lo tanto tampoco hace falta que vos lo pases a mano.
Salu2!!
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